Essa especialidade abrange o funcionamento do: esôfago, estômago, intestino, fígado, pâncreas e vias biliares.

As afecções mais comuns são gastrite, pancreatite, hepatite ou hepatopatias crônicas, colangite, mucocele, doença inflamatória intestinal, linfangiectasia, além de possibilidade de comprometimento por células neoplásicas (ex: linfoma). Também podem ocorrer secundariamente a doenças hormonais, ingestão de corpos estranhos e a endoparasitas.